Klínísk merking AFP, eða alfa-fetópróteins, fer eftir samhenginu sem það er mælt í. Hér eru nokkrar af helstu klínísku merkingum AFP:
1. Greining á AFP innihaldi í sermi hjá börnum: aukið AFP innihald í lifrarkrabbameini, lifrarkrabbameini, kynkirtlafrumukrabbameini, lifrarbólgu o.fl.
2. Greining á AFP-innihaldi í sermi hjá fullorðnum: AFP-innihald eykst hjá 60% ~ 70% sjúklingum með aðal lifrarkrabbamein, sem og hjá sjúklingum með krabbamein í eistum, æxli í eggjastokkum, illkynja teróma, briskrabbameini, magakrabbameini, þarmakrabbameini og lungna krabbamein.
3. Hjá sjúklingum með góðkynja lifrarsjúkdóma eins og bráða og langvinna lifrarbólgu og skorpulifur jókst AFP-magn í sermi mismikið, en flestir þeirra voru lægri en 1000ug/L, sem tengdist stigi dreps og endurnýjunar lifrarfrumna.
4. Aukning AFP í góðkynja lifrarsjúkdómum er tímabundin og varir í 2-3 vikur. Illkynja æxli hækka stöðugt. Þess vegna getur kraftmikil athugun á AFP innihaldi í sermi ekki aðeins aðgreint góðkynja lifrarsjúkdóm frá illkynja lifrarsjúkdómi, heldur einnig greint lifrarkrabbamein á fyrstu stigum.
5. Við lífeðlisfræðilegar aðstæður er alfa-fótóprótein seytt af nýfæddum lifrarfrumum á meðan lifrarfrumur fósturs eru ekki fullþróaðar (aðgreindar). Magn alfa-fótópróteins sem seytt er út er mikið, sem getur borist inn í blóð móður með naflastrengsblóði, þannig að þungaðar konur á meðgöngu verða jákvæðar fyrir alfa-fótóprótein.